Artículos en revistas con arbitraje indizadas (Web of Science, JCR, SCOPUS)
1.- Insight on the interaction between the scorpion toxin blocker Discrepin on potassium voltage-gated channel Kv4.3 by molecular dynamics simulations
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2.- Calcium inhibits penetration of Alzheimer's A?142 monomers into the membrane
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3.- Insight on the interaction between the scorpion toxin blocker Discrepin on potassium voltage-gated channel Kv4. 3 by molecular dynamics simulations
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4.- Effect of membrane lipid fluidity, composition, and charge on the ability of the antimicrobial peptide ascaphin-8 to insert into the membrane and form pores.
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5.- Imidazole and nitroimidazole derivatives as NADH?fumarate reductase inhibitors: Density functional theory studies, homology modeling, and molecular docking.
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6.- Computational studies of membrane pore formation induced by Pin2.
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7.- An Overview of Several Inhibitors for Alzheimers Disease:
Characterization and Failure
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8.- Computational studies of membrane pore formation induced by Pin2
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9.- Estimation of pore dimensions in lipid membranes induced by peptides and other biomolecules: A review
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10.- Insights into the Molecular Inhibition of the Oncogenic Channel
KV10.1 by Globular Toxins
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11.- Insights into the molecular inhibition of the oncogenic channel Kv-10.1 by globular toxins
12.- Computational studies of membrane pore formation induced by Pin2
13.- Biophysical characterization of the insertion of two potent antimicrobial peptides-Pin2 and its variant Pin2 [GVG] in biological model membranes
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14.- Folding profiles of antimicrobial scorpion venom-derived peptides on hydrophobic surfaces: a molecular dynamics study
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15.- Título: Biophysical characterization of the insertion of two potent antimicrobial peptides-Pin2 and its variant Pin2[GVG] in biological model membranes
Autores: Brandt Bertrand, Sathishkumar Munusamy, José-FranciscoEspinosa-Romero, Gerardo Corzo, Iván Arenas Sosa, Arturo Galván-Hernández, Iván Ortega-Blake, Pablo Luis Hernández-Adame, JaimeRuiz-García, José-LuisVelasco-Bolom, Ramón Garduño-Juárez, Carlos Munoz-Garay
Revista: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, vol 1862, 183105, 2020.
Estatus: PUBLICADO
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16.- Título:Folding profiles of antimicrobial scorpion venom-derived peptides on hydrophobic surfaces: a molecular dynamics study
Autores: José Luis Velasco Bolom, Gerardo Corzo y Ramón Garduño Juárez
Revista: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
Volumen: 2019
Paginas: 11
Fecha de publicación en linea: 02 de agosto del 2019
Estatus: PUBLICADO
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17.- Contreras-Romo, M. C., Martínez-Archundia, M., Deeb, O., Åšlusarz, M. J., Ramírez-Salinas, G.,
GARDUÑO-JUÁREZ, R., Quintanar-Stephano, A., Ramírez-Galicia, G., Correa-Basurto, J.
Exploring the ligand recognition properties of the human vasopressin V1a receptor using QSAR and molecular modeling studies. Chemical Biology & Drug Design 83(2), 207-223 DOI: 10.1111/cbdd.12229 IF 2013 2.507, (2014).
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18.- Villarreal-Ramirez, E.,
Garduño-Juarez, R., Gericke, A., & Boskey, A.
The role of phosphorylation in dentin phosphoprotein peptide absorption to hydroxyapatite surfaces: a molecular dynamics study. Connective tissue research, 55(S1), 134-137. DOI:10.3109/03008207.2014.923870 IF 2013 1.982. (2014).
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19.- Guillermo Ramírez-Galicia, José Correa-Basurto, RAMÓN GARDUÑO-JUAREZ, Omar Deeb,
“Exploring QSARs for Inhibitory Effect a Set of Heterocyclic Thrombin Inhibitors by Multi Linear Regression Refined by Artificial Neural Network and Molecular Docking Simulations” J ENZ INH MED CHEM, 27(2):174-186 (2012)
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20.- Guillermo Ramírez-Galicia, Heidy Martínez-Pacheco, RAMÓN GARDUÑO-JUÁREZ, Omar Deeb,
“Exploring QSARs of Antiamoebic Agents of Isolated Natural Products by MLR, ANN and RTO” MEDICINAL CHEMISTRY RESEARCH 21:2501-2516 (2012)
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21.-
Omar Deeb, Martha Cecilia Rosales-Hernández, Carlos Gómez-Castro,
Garduño-Juárez R., José Correa-Basurto, Exploration of human serum albumin binding sites by docking and molecular dynamics flexible ligand-protein interactions, BIOPOLYMERS 93(2):161-170 (2010).
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Artículos in extenso de memorias de congresos y proceedings (No resúmenes)
1.-
Luis Germán Pérez-Hernández, Katya Rodríguez-Vázquez, Garduño-Juárez Ramón. Parallel particle swarm optimization applied to the protein folding problem. 2009 Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO'2009), ACM Press, Montreal, Canada, July 8-12, 2009, pp. 1791-1792, ISBN 978-1-60558-325-9
2.-
Juan-Antonio Modragón-Sánchez, Edmundo Mendieta-Fernández,
Ramón Garduño-Juárez, Gilberto Sánchez-González. Metadynamics study of the free energy surface of a G-QUADRUPLEX DNA structure. Biophysical Journal, Society Meeting – Vol. 98 (3) Supplement 1, January 2010, Page 265a
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Capítulos de libros
1.- Ramón Garduño Juárez.,
Aplicación de las Matemáticas en la vida cotidiana. La Ciencia de Morelos para el Mundo (Union de Morelos). 03/02/2014.
2.- Garduño R. "Cuatro segundos que pueden salvar tu vida: las leyes físicas básicas detrás del manejar seguro". En "CIENCIA COMPARTIDA, SOCIALIZANDO EL CONOCIMIENTO", Año 1, Número 1, julio - septiembre, 2010, México D.F.